白癜风是什么样症状的 http://news.39.net/bjzkhbzy/171129/5885336.html大家好,这是我解读的第三十九篇文献,本篇文章于年4月1日发表于Gastroenterology[IF=17.],题目为《NovelFecalBiomarkersThatPrecedeClinicalDiagnosisofUlcerativeColitis》,本文对比了溃疡性结肠炎(UC)患者发病前、发病后及健康对照的粪便菌群组成及功能,发现UC患者的粪便蛋白水解显著增加,而这一变化发生在UC发病之前,并与特定的肠道菌群组成变化相关。该研究结果提示,粪便蛋白水解活性(尤其是弹性蛋白酶活性)或可作为非侵入性生物标志物,用于监测UC高危个体的炎症状态,并可作为潜在治疗靶点。
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背景介绍
溃疡性结肠炎(UC)是炎症性肠病中的一种,呈慢性复发性,当前依然无法治愈。IBD的确切病因尚不清楚,但被认为与遗传,免疫和缓解因素有关,包括微生物组成和功能的变化。与健康个体相比,IBD患者在拟杆菌属方面的丰富性和多样性下降,在功能改变方面发现粪便中短链脂肪酸丁酸酯的浓度降低。
因此,研究人员对具有IBD发病风险(pre-UC)的人群进行前瞻性随访,并对其进行16S核糖体RNA(rRNA)基因测序,鸟枪法宏基因组测序以及代谢组学方面进行研究。
图1.进展为UC的高危人群与未进展为UC的高危人群粪便微生物种群不同
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实验结果
结果(1):进展为UC的高危人群的肠道微生物组成与未进展为UC的高危人群以及健康人不同。通过对pre-UC,post-UC和HC的粪便样品进行微生物组分析,发现post-UC单独成簇,并且α-多样性显著下降,安德克氏菌属(Adlercreutzia)丰度相对减少,如图1。
图2鸟枪法宏基因组测序可以确定UC发作前粪便微生物群的变化
研究人员对部分参与者进行了鸟枪法宏基因组测序,发现post-UC中Adlercreutziaequolifaciens和Bifidobacterium均减少,与健康人相比,pre-UC中Flavonifractorplautii,Coprococcuscatus和Parabacteroidesmerdae增加。这些数据表明,尽管与健康人相比,pre-UC已经可以观察到微生物方面的差异,但病情确定是微生物变化的主要因素,因为微生物变化在post-UC中最为明显。
结果(2):在pre-UC中微生物群落中的微生物功能发生变化。对鸟枪法宏基因组测序的粪便样品进行功能分析,结果发现,pre-UC存在4条独特的通路,与HC样品相比,pre-UC在“l-精氨酸生物合成(I,IV),生物素生物合成II,转移RNA电荷和多胺生物合成I的超途径”等通路富集。
宏基因组学数据进一步分析发现了超过个细菌基因家族。其中个与蛋白酶或多肽酶具有相关性。此外,根据蛋白酶或肽酶相关基因家族,可以将pre-UC和HC区分开,如图3。综上所述,这些数据表明,在诊断之前,有关蛋白质和氨基酸代谢的微生物组成发生变化。
图3.热图分析将pre-UC和HC分开
结果(3):pre-UC中的粪便蛋白水解活性增加,并且具有细菌成分,如图4。
图4.粪便蛋白水解方面的差异在UC诊断之前就已经检测到
关键点
①对比健康对照(HC)、发病前(pre-UC)及发病后(post-UC)UC患者的粪便菌群;
②post-UC的粪便菌群组成与HC及pre-UC不同;
③在pre-UC及post-UC的粪便中,蛋白水解及弹性蛋白酶活性显著增加;
④在HC与pre-UC的粪便中,弹性蛋白酶活性与Adlercreutzia等潜在有益菌的相对丰度呈负相关,而与普通拟杆菌等蛋白水解分类群的相对丰富呈正相关;
⑤相比于定殖HC菌群的小鼠,定殖pre-UC菌群的小鼠表现出更高的粪便蛋白水解活性及炎症应答。
参考文献:
GalipeauHJ,CamineroA,TurpinW,Bermudez-BritoM,SantiagoA,LibertucciJ,ConstanteM,RaygozaGarayJA,RuedaG,ArmstrongS,ClarizioA,SmithMI,SuretteMG,BercikP;CCCGenetics,Environmental,MicrobialProjectResearchConsortium,CroitoruK,VerduEF.NovelFecalBiomarkersThatPrecedeClinicalDiagnosisofUlcerativeColitis.Gastroenterology.Apr;(5):-.doi:10./j.gastro..12..EpubDec10.PMID:.
本文系作者个人观点,不对用药构成推荐。
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