疾病症状_结肠溃疡

当LncRNA邂逅结肠癌

近年来LncRNA可是研究的大热门，随随便便都是CNS及其子刊的座上宾，长链非编码(LongnoncodingRNAs,lncRNAs)是肿瘤进展的关键分子，但其在结直肠癌Colorectalcancer(CRC)转移中的作用尚未被系统阐明。今天我们来看一篇文章发表在MolecularCancer期刊上，影响因子将近11，本文目的是探索LncRNA分子在肿瘤发生，发展甚至是迁移的过程中发挥重要机制，下面一起来看看LncRNA邂逅结肠癌会擦出哪些火花。I.研究背景长链非编码(LongnoncodingRNAs,lncRNAs)的长度超过nt，其蛋白编码能力有限或没有蛋白编码能力，在肿瘤的发生和发展过程中发挥着致癌和抑癌的双重作用。LncRNAs可以通过多种机制调控基因表达，包括染色质的去除、转录调节因子活性的调节和转录后修饰，其表达失调已被报道可调节各种类型癌症的进展如膀胱癌、前列腺癌、肺癌、乳腺癌、胃癌、结肠直肠癌等，并且越来越多的证据表明，LncRNAs可以触发转移进程，促进肿瘤的发生，而结直肠癌(CRC)又称大肠癌是世界性的重大公共卫生问题，转移和上皮间质转化是CRC相关死亡的主要原因。但CRC发病机制，尤其是转移的确切分子机制仍有待充分阐明，因此，进一步鉴定CRC相关的LncRNAs并研究其在CRC中的作用势在必行。II.研究思路解析首先，作者通过芯片技术检测正常和CRC组织中lncRNA的表达谱，通过差异分析发现都差异高表达的LncRNA-RP11，即RP11-J23.1(RP11)，紧接着通过PCR证实其在实验组中高表达，已有的数据库结果也证实这种趋势。RP11在CRC组织和细胞中高表达紧接着作者在体内外检测了新型lncRNA即RP11-J23.1(RP11)在CRC发生发展中的生物学作用，首先证实RP11过表达能够明显促进CRC细胞的迁移和扩散能力，过表达RP11的CRC细胞呈现纺锤状成纤维细胞样外观，提示RP11可能与上皮间质转化(epithelialmesenchymaltransition,EMT)和癌症转移相关。接着作者通过体外高表达RP11基因发现能够促进肿瘤的增殖。此外体内实验显示，通过尾部注射方式导入稳定高表达RP11的癌症细胞，饲养8周后发现这些细胞能够转移至小鼠肝脏组织中。这些数据表明，RP11可以诱导CRC细胞的迁移、侵袭和EMT。体内外检测RP11在CRC发生发展中的生物学作用随后进行机制探究，这一步可谓煞费苦心，RP11的功能机制常见的是通过顺势调控的模式或者结合下游结合蛋白进行。通过复杂的实验首先证明RP11的功能机制不是通过顺势调控的模式，接着作者通过Zeb1RIP-LncRNAPCR和RP11PullDown-质谱技术，证实Zeb1与RP11在mRNA和蛋白层面都不是直接结合的关系。为证实RP11是如何调控的？作者在大量的实验中找到与RP11直接结合的hnRNPA2B1蛋白。已有研究表明hnRNP2B1是一种RNA结合蛋白，并且通过结构证实其的确能够恰到好处的结合RP11。总的来说，RP11通过形成RP11-hnRNPA2B1-mRNA复合体调控下游基因的表达。III．小结最终作者得出结论新发现的lncRNARP11可以通过翻译后上调Zeb1来诱导CRC细胞的迁移和扩散，证实了lncRNARP11在EMT和肿瘤转移中的调节作用。由于RP11高表达与淋巴结转移阳性及TNM进展期相关，因此文章提示RP11可作为预测CRC转移及预后的重要生物标志物或治疗靶点指标进行进一步临床测试。IV.研究亮点本文之所以能发在10分以上期刊，首先文章运用先进的LncRNA测序、MeRIP-qPCR、RNAPullDown、LncRNA定量PCR等技术，通过大量复杂的实验，为临床结肠癌转移研究不仅提供一种Biomarker，更重要的是提供了一种新型的思路和模式。当然，文章还进行了大量的甲基化机制的探索，为文章锦上添花，增色不少。感兴趣的小伙伴可以自行去阅读原文，最后，附一张文章大致思路图。V.延伸阅读一般如何研究lncRNA呢？像文章中所述，可以从寻找到lncRNA分子、分子表型研究以及lncRNA通过何种机制调节表型等来进行研究，找寻具体lncRNA分子可以通过基因芯片或高通量测序筛选等方式；然后通过PCR/WB等生物实验寻找lncRNA分子的表型或者上下游的链接关系；最后深度挖掘lncRNA分子通过何种机制作用于生物标志物或临床样本，从而指导对疾病的预防和治疗，便是一篇有价值的文章。明白不？「好文」，点个「好看」再走吧！预览时标签不可点
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